Marqueur génétique

Le marqueur génétique est une séquence polymorphe d'ADN facilement détectable, utilisée en cartographie génétique pour «baliser» le génome.

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Génétique

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Le marqueur génétique est une séquence polymorphe d'ADN facilement détectable, utilisée en cartographie génétique pour «baliser» le génome.

Jusqu'en 1980, les marqueurs génétiques étaient seulement des gènes polymorphes, cartographiés à partir de l'analyse des phénotypes. Les nouvelles biotechnologies (PCR…) permettent une analyse directe du polymorphisme des séquences d'ADN pour dresser une carte génétique.

Il existe différentes sortes de marqueurs : STS, RFLP, microsatellites, minisatellites, RAPD, SNP, EST, gènes...

Caractéristiques

Selon Bretting et Widrlechner (1995), les conditions parfaites d'un marqueur génétique sont les suivantes^[1] :

être polymorphe, pour pouvoir aisément différencier les individus ou les lignées ;
être assez neutre, que ce soit au niveau de la valeur du caractère étudié que de la valeur sélective ;
être codominant, pour pouvoir distinguer les hétérozygotes des homozygotes ;
être un caractère mendélien à hérédité simple
ne pas être pléiotropique ou épistatique
être dispersé le long du génome
ne pas être lié à un autre marqueur
être stable quelquesoit le stade du développement
ne pas avoir d'impact sur la croissance ou la reproduction sexuée

être aisément observable, sans ambiguïté envisageable
être peu coûteux

Notes et références

↑ Daniel Prat & al, Analyse du génome et gestion des ressources génétiques forestières [lire en ligne], pp. 73-74, éd. Quæ, 2006, 456 p. (ISBN 2738012272) .

A ne pas confondre

Gène marqueur, servant de témoin de transformation génétique,
Marqueur biologique, témoin de perturbations écologiques,

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